СКУ им. М. Козыбаева приглашает на Осеннюю школу по функциональной геномике и биоинформатике
- Редакция "СО"
- 3 окт.
- 1 мин. чтения
Северо-Казахстанский университет имени Манаша Козыбаева приглашает студентов, преподавателей, исследователей, докторантов и магистрантов принять участие в Осенней школе по функциональной геномике и биоинформатике, которая состоится 20–24 октября 2025 года в г. Петропавловске.
Школа проводится при поддержке Центра агрокомпетенции СКУ и является первым мероприятием подобного уровня в Казахстане, посвящённым современным технологиям анализа и аннотации геномов. Участники получат уникальную возможность пройти обучение под руководством международных специалистов и приобрести практические навыки работы с реальными данными секвенирования.
Программа Осенней школы
День 1. Введение в биоинформатику и технологии секвенирования
Основы биоинформатики и стратегии секвенирования целых геномов.
Платформы секвенирования (Illumina, Oxford Nanopore, PacBio).
Практика: работа с форматами данных (FASTQ и др.), первичная оценка качества секвенирования.
День 2. Сборка и аннотация бактериальных геномов
Теория сборки: алгоритмы и стратегии.
Практика: сборка бактериального генома с Illumina-прочтениями, оценка качества (N50, BUSCO, k-mer анализ).
Автоматизированная аннотация прокариотических геномов.
День 3. Геномы эукариот и мобильные элементы
Особенности эукариотических геномов.
Мобильные элементы, их роль и методы аннотации.
Практика: работа с инструментами EDTA, RepeatMasker.
День 4. Сборка и аннотация эукариотических геномов
k-mer анализ для оценки характеристик генома.
Практика: сборка генома с HiFiasm (PacBio), маскирование повторов и аннотация генов.
День 5. Завершающий день
Продвинутая аннотация генов у эукариот.
Работа с браузерами геномов (JBrowse/IGV).
Подготовка и отправка данных в международные репозитории (NCBI, ENA).
Вручение сертификатов.
Условия участия
Стоимость: 200,000 KZT для резидентов; 700 USD для нерезидентов.
Требования: наличие степени не ниже BSc в области биологии; обязательна подача CV и мотивационного письма (до 300 слов).
Время и место проведения: 9:00–17:00, 20-24 октября 2025 года, учебнно-лабораторный корпус СКУ.
Рекомендуемые отели: «Qyzyl Zhar» (специальные тарифы), «Green Which»
Комментарии