Манаш Қозыбаев атындағы Солтүстік Қазақстан университеті функционалдық геномика және биоинформатика арналған мектепке қатысуға шақырады

Манаш Қозыбаев атындағы Солтүстік Қазақстан университеті студенттерді, оқытушыларды, зерттеушілерді, докторанттар мен магистранттарды 2025 жылғы 20-24 қазанда Петропавл қаласында өтетін Функционалдық геномика және биоинформатика бойынша күзгі мектепке қатысуға шақырады.

Мектеп СҚУ агроқұзырет орталығының қолдауымен өткізіледі және Қазақстандағы геномдарды талдау мен аннотациялаудың қазіргі заманғы технологияларына арналған осындай деңгейдегі алғашқы іс-шара болып табылады. Қатысушылар халықаралық мамандардың жетекшілігімен оқудан өтуге және секвенирлеудің нақты деректерімен жұмыс істеудің практикалық дағдыларын алуға бірегей мүмкіндік алады.

Күзгі мектептің бағдарламасы:

1-Күн. Биоинформатика мен секвенирлеу технологиясына кіріспе

Биоинформатика негіздері және тұтас геномдарды секвенирлеу стратегиясы.

Секвенирлеу платформалары (Illumina, Oxford Nanopore, PacBio).

Практика: деректер форматтарымен (FASTQ және т.б.) жұмыс, секвенирлеу сапасын

бастапқы бағалау.

2-күн. Бактериялық геномдарды жинау және аннотациялау

Құрастыру теориясы: алгоритмдер мен стратегиялар.

Практика: Illumina-оқулары бар бактериялық геномды құрастыру, сапаны бағалау (N50, BUSCO, k-mer талдау).

Прокариотикалық геномдарды автоматтандырылған аннотациялау.

3-күн. Эукариот геномдары және мобильді элементтер

Эукариотикалық геномдардың ерекшеліктері.

Мобильді элементтер, олардың рөлі және аннотация әдістері.

Практика: EDTA, Repeat Masker құралдарымен жұмыс.

Күн 4. Эукариотикалық геномдарды жинау және аннотациялау

геномның сипаттамаларын бағалау үшін k-mer талдауы.

Практика: HiFiasm (PacBio) геномын құрастыру, қайталауды бүркемелеу және гендерді аннотациялау.

5-күн. Соңғы күн

Эукариоттарда гендердің озық аннотациясы.

Геном браузерлерімен жұмыс істеу (JBrowse/IGV).

Деректерді дайындау және халықаралық репозиторийлерге (NCBI, ENA) жіберу.

Куәліктерді тапсыру.

Қатысу шарттары

Құны: резиденттер үшін 200,000 KZT; резидент еместер үшін 700 USD.

Талаптар: биология саласында BSc төмен емес дәреженің болуы; CV және уәждеме хатты беру міндетті (300 сөзге дейін).

Өткізу уақыты мен орны: 2025 жылғы 20-24 қазан сағат 9: 00-17: 00, СҚУ оқу-зертханалық корпусы.

Ұсынылатын қонақ үйлер: «Qyzyl Zhar» (арнайы тарифтер), «Green Which».